Causa:
Quando o campo de Inscrição Estadual estiver preenchido no cadastro do destinatário, sendo este isento, será exibido a mensagem: "Rejeição: NF-e com indicação de destinatário isento de IE, com a informação da IE do destinatário"

Solução:
No caso do cliente ser isento de Inscrição Estadual, o campo deve ficar em branco.